lunes, 2 de diciembre de 2013

Búsquedad de candidato para becas Formación Profesorado Universitario.



Se busca candidato para apoyarle en su solicitud de beca de Formación de Profesorado Universitario que se desarrollará en la Universidad Politécnica de Cartagena (UPCT) sobre el tema genérico de calidad orientada a mejora genética y biotecnología en fruto de melón. Plazo de presentación: 25 Noviembre a 16 de Diciembre de 2013 (14 h hora peninsular).

Requisitos mínimos:
-  Nacionalidad española o título homologado en España.
-  Fecha de finalización de estudios con posterioridad al 1 de enero de 2010, en el caso de licenciados o ingenieros o equivalente en sistemas universitarios extranjeros no adaptados al EEES.
-  Estar matriculados en el programa de doctorado TAIDAA de la UPCT (o de otra universidad española) en el curso 2013-2014.
-   Título de en ingeniería Agronómica o licenciatura en química, biología, biotecnología o similares.
-  Nota media de expediente académico mínima calculada según convocatoria. Para ciclo largo es de 6.71/10 (ingeniería) y 6.93/10  (ciencias) (Pág. 92907).
-  Buen nivel de inglés.
-  Conocimientos de ofimática a nivel de usuario.
-  Motivación para trabajo en equipo y dedicación exclusiva e intensa para poder obtener su tesis doctoral según los requisitos en España.

Más información en:
https://www.boe.es/boe/dias/2013/11/21/pdfs/BOE-A-2013-12235.pdf

viernes, 8 de noviembre de 2013

Aromas volátiles y textura del fruto de melón


Uno de los genes que produce una mayor firmeza del fruto de melón está localizado en el cromosoma X del mismo y cambia el perfil de aromas volátiles de la pulpa tal y como hemos demostrado con dos líneas casi isogenicas en el siguiente trabajo utilizando diferentes métodos estadísticos univariantes y multivariantes.
El trabajo contiene numerosa información suplementaria producto de los diferentes metodos estadísticos utilizados y que solamente está accesible vía web en el enlace si se tiene acceso a la revista. Aquí podéis leer como mínimo su resumen.

Dos-Santos, N., Bueso, M., Fernández-Trujillo, J.P. 2013. Aroma volatiles as biomarkers of textural differences at harvest in non-climacteric near-isogenic lines of melon. Food Research International. 54(2): 1801-1812. http://dx.doi.org/10.1016/j.foodres.2013.09.031

Línea casi isogénica SC7-1


 También hemos discutido cuáles pueden ser las rutas metabólicas de producción de aromas afectadas por este aumento de firmeza del fruto. Por otra parte la dureza del fruto entero no parece tener la misma relación directa pero también parece estar relacionada  con ciertos volátiles y con el metabolismo de la metionina, ya que se utilizó una línea casi isogénica no climatérica que daba frutos enteros algo más blandos

Este trabajo forma parte de la tesis doctoral de Noelia dos Santos Carillo en la Universidad Politécnica de Cartagena dirigida por el profesor Juan Pablo Fernández Trujillo y codirigida por Antonio Monforte.

jueves, 19 de septiembre de 2013

Melon fresh fruit quality from field to fork: a quality-oriented breeding and multivariate perspective

En Varsovia, invitado por la organización de este congreso sobre nuestras investigaciones en melón este mes de Septiembre dentro de los proyectos financiados por el Ministerio de Economía e Innovación y los fondos regionales EU-FEDER y la Fundación Séneca de la Región de Murcia. La conferencia claro es en inglés, pero podéis aprovechar las herramientas de Google Translator.

Esta es la referencia del congreso que os menciono:

Fernández-Trujillo, J.P. Dos-Santos, N., Bueso, M.C. Esteva, J., Martínez, J.A., Monforte, A.J. 2013. Melon fresh fruit quality from field to fork: A quality-oriented breeding and multivariate perspective. En: Quality of fresh produce, herbs and vegetables – from field to fork; September 18-19, 2013. Warsaw University of Life Sciences – SGGW. Warsaw, Poland. Conferencia invitada. Book of abstracts p.39-40.  

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A conference entitled: "Melon fresh fruit quality from field to fork: A quality-oriented breeding and multivariate perspective" was delivered on Thursday 19 September in a international mini-Workshop entitled "Quality of fresh produce, herbs and vegetables – from field to fork" organized in Warsaw (Poland) by Prof. Marek Gjewski, the lider of the Pakeltu Horticulture Warsaw Plant Heatlh Initiative during September 18-19. Warsaw University of Life Sciences – SGGW. Warsaw, Poland. I was invited to participate in this mini-workshop together with other colleagues from different part of Europe. This is the  link of the content of the mini-workshop..

http://f2f.woiak.sggw.pl/index.php?option=com_content&view=category&layout=blog&id=59&Itemid=148&lang=en






And this is a copy of the book of abstracts.

Melon fresh fruit quality from field to fork: A quality-oriented breeding and multivariate perspective
JUAN PABLO FERNÁNDEZ TRUJILLO1,*, NOELIA DOS-SANTOS1, MARíA C. BUESO2, JUAN ESTEVA3, juan antonio martínez3, ANTONIO J. MONFORTE4
1 Department of Agricultural and Food Engineering. Technical University of Cartagena (UPCT). Paseo Alfonso XIII, 48. ETSIA and Institute of Plant Biotechnology. E-30203 Cartagena (Murcia), Spain.
2 Department of Applied Mathematics and Statistics. UPCT. Campus Muralla del Mar, Doctor Fleming s/n. ETSII. E-30202 Cartagena (Murcia), Spain.
3 Department of Plant Production. UPCT. Paseo Alfonso XIII, 48. ETSIA and Institute of Plant Biotechnology. 30203 Cartagena (Murcia), Spain
4 Instituto de Biología Molecular y Celular de Plantas (IBMCP). CSIC/UPV. Ciudad Politécnica de la Innovación - Edificio 8E Ingeniero Fausto Elio s/n,  46022 Valencia, Spain.

Melon quality is a multivariate character with critical importance for melon consumers. Quality of horticultural crops can be measured instrumentally qualitatively or quantitatively but the sensory perception is the key trait for consumers. Fruit properties measured instrumentally may help us to verify proper fruit quality depending on the link of the postharvest chain involved. This conference summarizes results particularly from a quality-oriented breeding perspective that could contribute to improve or keep melon fruit quality. Examples of identification of quantitative trait loci (QTLs) associated with pre and postharvest factors affecting final fruit quality are reported.
            Preharvest factors and/or postharvest manipulation (storage, transport) may induce several fruit disorders as melon cracking that we have reviewed recently. A combination of different preharvest and postharvest factors contributes to the development of this disorder. In greenhouse production, environmental effects can be minimized but in open-field production uncontrolled factors as excessive rain and sun exposure together with inappropriate fertigation and lack of preharvest treatments contribute to a sudden development of the disorder as soon as two weeks before harvest and during the harvest season. Inadequate harvest and postharvest practices and genetic factors have also been identified as critical with some commercial cultivars, accessions and near-isogenic lines (NILs) of melon more prone to suffer cracking than others. Particularly QTLs associated with climacteric ripening or non-climacteric ripening have been identified for example in chromosomes III, VI and X of melon.
            Another set of critical quality traits  for consumer choices  most of them having an important genetic component apart from environmental or environmental x genetic components are morphological traits (fruit size and shape), aspect, netting, sutures, spots, fruit color, aroma, texture, and nutrient content (sugars, organic acids and amino acids, carotenoids, vitamins, etc.). Other complex traits of interest are for example the potentiality of the cultivar for fresh-cut product or the expected shelf-life, or improved resistance to physiological disorders (mealiness, chilling injury during storage, etc.), weight loss or decay. Successful attempts to modify some characters associated with physical traits are in progress, whereas the manipulation of external fruit characteristics as perfect round-shape and reduced size, netted melons instead of non-netted ones, etc. is currently feasible by selecting QTLs mapped during the last 10 years and of the relatively high heritability of these characters.
            Melon aroma is a very complex trait that depends on the combination of multiple individual compounds that can be measured either destructively or nondestructively during melon ripening. Headspace solid phase microextraction (SPME) or stir-bar sorptive absorption (HSSE, SBSE) to extract and later characterize melon aroma by gas-chromatography mass-spectrometry allow obtaining a melon profile to optimize harvest and purchase experiences. Some aromas typical of recently harvested melons and senescent melons have been identified using NILs. Also, ethylene-dependent and independent aroma during ripening and the principal one from a quantitative and olfactory point of view are reported, mostly acetate, non-acetate and sulfur-derived ester compounds, alcohols and aldehydes in the flesh and also some characteristic terpenes in the skin. Aromatic precursors of these aroma volatiles include lipids but also aminoacids (phenylalanine, methionine, leucine, isoleucine, or valine) or carotenoids. The complexity of quality traits and especially melon aroma requires the application of statistical multivariate methods in order to represent the high-dimensional observed data sets into lower-dimensional spaces to extract the most discriminant features. Partial least squares discriminant analysis (PLS-DA) and random forest (RF) analysis together with some descriptive methods such as principal component analyses are very useful to correlate sensory and instrumental measurements. In addition, these methods have revealed useful to detect interesting QTL effects in near-isogenic lines of melon or to identify the main discriminant differences among melon cultivars. Finally, other statistical techniques such as hierarchical clustering are being tested in order to discern the main metabolic pathways and potential aroma precursors responsible of melon aroma.
            Melon texture is one of the traits more important in the development of the last melon cultivars, particularly because of the great link with “long-life” characters. Firm and crunchy texture seems to be one of the keys of successful new cultivars but having the same flavor than the traditional cultivars. Textural traits with double use such as flesh juiciness or undesirable traits such as mealy texture should be taken into account.
            Many traits reported above are ripening-dependent and particularly ethylene-dependent or ethylene-independent traits. Climacteric types have both kind of traits, but skin color, aroma, texture, or nutrient content are really important in some climacteric types.   Two introgressions of the melon accession PI 161375 into the ´Piel de sapo´ genetic background located in linkage groups III and VI interact epistatically and advances climacteric response due to advanced ethylene biosynthesis. These types of climacteric NILs obtained from non-climacteric parentals have been very useful for diverse quality and physiological studies.
            Mapping QTLs of complex sensory traits and changes in diverse situations of the postharvest chain is still underway. An important variability depending on ethnic and consumer attitude is critical but multivariate methodologies help to determine the main factors in order to determine global quality acceptance. Critical attributes are textural traits in non-climacteric types or retro-nasal aroma and off-flavors in climacteric and aromatic cultivars. However, companies are more prone to use new traits to differentiate new cultivars in the market such as exotic ones as the introduction of a QTL on LG VIII for high acidic-taste melons with increased citric acid content.
The new biotechnological and genomic tools useful for improving melon quality include the sequence of the melon genome, molecular markers, dense genetic maps, TILLING and ECOTILLING platforms, microarrays for gene expression, etc. The integration of this knowledge with cost-effective Next-Generation Sequencing approaches as RNAseq or Genotype by Sequence will speed up the design of new cultivars that will meet consumer expectations under different postharvest scenario.

jueves, 29 de agosto de 2013

Nueva revista (Agricultural Communications)

Mi colega Mohammad Mahdi Jowkar, profesor doctor iraní que ha estado con nosotros en dos campañas de melón, concretamente la de 2005 y la de 2009, inicia este mes de agosto de 2013 una nueva etapa como managing editor de una revista que todavía no está indexada (Agricultural Communications), y en la que estoy en el comité editorial o "editorial board". http://www.agricommun.com/ Este es su mensaje. "Agricultural Communication is seeking for well qualified scientists in order to complete it reviewers’ team. If you are interested please send your inclination letter to editors’ email on the submission page. The required criteria are: holding a Ph.D. degree besides having good English skills. Thanks. Managing Editor." Por si es de vuestro interés para vuestros trabajos, especialmente para aquellos multidisciplinares en la frontera de la ciencia que estén iniciando su recorrido. Concretamente "Agricultural Machinery, Agronomy, Animal Science, Biotechnology, Cytogenetic, Dairy Science, Food Science and Technology, Forestry, Horticulture, Plant Breeding, Irrigation, Plant Microbiology, Plant Nutrition, Plant Pathology, Poultry, and Soil Sciences." Están reclutando revisores con buen nivel de inglés y PhD (doctorado) en las disciplinas de la revista. Como quien escribe también está en el comité editorial de otras revistas en Colombia (en castellano una, otra en inglés), pues animo especialmente a los estudiantes a tratar de escribir y publicar.

miércoles, 28 de agosto de 2013

Evolución en frutos enteros del perfil aromático durante la maduración en la línea climatérica casi isogénica de melón SC3-5-1 mediante twister de PDMS.

Acabamos de publicar este trabajo sobre la evolución de determinados aromas de una línea casi isogénica de melón que contiene los dos QTLs del climaterio de este fruto en los cromosomas III y VI. Utiliza la técnica de extracción en el espacio de cabeza del aroma mediante barras extractoras absorbedoras de PDMS, técnica que ya utilizamos con éxito en algún trabajo anterior publicado en Acta Horticulturae en 2012. La técnica es sencilla y tiene la enorme ventaja de ser no destructiva además de poder conservar las barras para su análisis automatizado posterior y durante varios meses. Su handicap es el coste de dichas barras (más de 50 € cada una), que por suerte ocupan poco sitio.

Fernández-Trujillo, J.P.; Dos-Santos, N.; Martínez-Alcaraz, R.; Le Bleis, I. Non-Destructive Assessment of Aroma Volatiles from a Climacteric Near-Isogenic Line of Melon Obtained by Headspace Stir-Bar Sorptive Extraction. Foods 2013, 2, 401-414
http://www.mdpi.com/2304-8158/2/3/401/
http://www.mdpi.com/2304-8158/2/3/401/pdf

Foto 1. Caja de viales en cuyo inerior se encuentran los twister de PDMS. Fotografía original tomada por Pablo Crespo.

Este trabajo es fruto de la codirección de Noelia dos Santos y Juan Pablo Fernández Trujillo de sendos proyectos fin de carrera de las alumnas que firman el trabajo en la Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica de la UPCT entre 2010 y 2012.

Rocío Martínez Alcaraz consiguió su título de Ingeniería Técnica Agrícola de la especialidad de Industrias en la ETSIA-UPCT.

Inès Le Bleis fue alumna con beca Erasmus procedente del Département Génie Biologique (Institut Univesitaire de Technologie). Université de Bretagne Occidentale. Quimper. France. Recibió la calificación de sobresaliente en su proyecto fin de carrera tras la estancia y obtuvo el Diplôme Universitaire et Technologique, Département Génie Biologique, option Industries Agroalimentaires.Inés Le Bléis quiere agradecer extensivamente aquí lo siguiente (ya que en el artículo va muy resumido: "I would like to thank the IUT de Quimper (University Technological Institute) and the UPCT for helping me in achieving this internship. I would also like to thank the Erasmus program for its contribution in the financing and cultural aspects of this training period in the year 2010."

Foto 2. Línea casi isogénica de melón SC3-5-1 durante uno de nuestros trabajos de muestreo de aromas mediante twister  (en este caso en la campaña 2011).

Agradecemos también en este medio al profesor del departamento de Ingeniería de Alimentos y del Equipamiento Agrícola y catedrático de la UPCT Alfredo Palop su magnífica y profesional coordinación del intercambio con Quimper desde hace muchos años. Gracias a él y a su buen hacer han venido estos alumnos y otros muchos a nuestro trabajo y a nuestro equipo de trabajo. Queda demostrado que el programa Erasmus, así como este programa de intercambio, puede servir incluso para fines más allá de los inicialmente previstos y que debiese mantenerse.

La financiación del trabajo ha sido posible gracias a fondos de la UE, del Ministerio de Ciencia e Innovación (AGL2010-20858) y varios proyectos financiados por la Fundación Séneca de la Región de Murcia (principalmente 11784/PI/09) y la Consejería de Educación y Cultura de la Región de Murcia (BIO-AGR06/02-0011).

El resumen del trabajo es el siguiente (espero poder traducirlo en una próxima versión de este post):

Non-Destructive Assessment of Aroma Volatiles from a Climacteric Near-Isogenic Line of Melon Obtained by Headspace Stir-Bar Sorptive Extraction 
Juan Pablo Fernández-Trujillo * , Noelia Dos-Santos, Rocío Martínez-Alcaraz† and Inés Le Bleis †
Department of Agricultural and Food Engineering, Technical University of Cartagena (UPCT), Paseo Alfonso XIII, 48, ETSIA & Institute of Plant Biotechnology, E-30203 Cartagena (Murcia), Spain
† These authors contributed equally to this work.

* Author to whom correspondence should be addressed. Received: 26 April 2013; in revised form: 2 August 2013 / Accepted: 17 August 2013 / Published: 28 August 2013

Abstract: A climacteric aromatic near-isogenic line (NIL) of melon (Cucumis melo L.) SC3-5-1 contained an introgression of the non-climacteric Korean cultivar “Shongwan Charmi” accession PI 161375 (SC) in the genetic background of the non-climacteric cultivar “Piel de Sapo” (PS). The aroma production was monitored during ripening at 21 °C in intact fruit using headspace sorptive bar extraction (HSSE). Bars were composed of polydimethylsiloxane (PDMS) and aromas were desorbed and analyzed by gas-chromatography mass-spectrometry. The aromatic profile was composed of 70 aromatic compounds plus 21 alkanes with a predominance of esters, particularly acetate (2-methylbutyl acetate, 2-methylpropyl acetate, hexyl acetate, and phenylmethyl acetate). Some compounds were severely affected by postharvest time. The acetate esters (3-methylbutyl acetate, butan-2-yl acetate and phenylmethyl acetate) decreased with ripening and sulfur-derived compounds (S-methyl butanethioate and S-methyl 3-methylbutanethioate) increased gradually with ripening. A few compounds increased at the senescence phase (propyl ethanoate). Other compounds such as hexadecanoic acid showed a marked decrease after harvest, some decreasing from a relative maximum at harvest (2-methylpropyl hexanoate; n-hexanoic acid; nonanoic acid).

Keywords: climacteric ripening; Cucumis melo L.; ethylene; introgression lines; fruit quality; HSSE; postharvest.

Foto 3. Inés Le Bléis durante su estancia en la UPCT, concretamente preparando muestras líquidas para analizar por cromatografía de gases-masas en el SAIT-UPCT el 27 de abril de 2010.

sábado, 10 de agosto de 2013

Decoloración de corteza amarilla en melón Honeydew, Amarillo y otros tipos

Seguimos recibiendo consultas de problemas relacionados con esta campaña. En este caso se trata de melones tipo Honeydew o Amarillo cultivados en la huerta de Murcia (España) (Fotos 1 y 2).


Foto 1. Aspecto de la plantación de melón Honeydew cultivado en la huerta de Murcia (España) en la que se detecta el problema de corteza blanquecina de la fotografía 2 (cortesía de Francisco J. Tovar Coll, con autorización).



Foto 2. Melones Honeydew cultivados en la huerta de Murcia con corteza amarilla blanquecina y aparentemente decolorada (cortesía de Francisco J. Tovar Coll, con autorización).

Dichas plantas a veces pueden haber sufrido previamente problemas de desarrollo anormal. Incluso, en
plantas con alto sombreo de los frutos estos pueden haber sufrido de escaldadura por sol. Dichas manchas se manifiestan al principio del desarrollo del fruto con menor desarrollo de coloración típica de cada variedad (foto 2). Pueden quedar blanquecinas (similar a lo que ocurre en la zona de la cama en contacto con el suelo, zona con más humedad y sin radiación solar) para más tarde adquirir colores pardos típicos del quemado por el sol o "sunscald".

Factores que pueden haber coadyuvado al desarrollo de este problema son una climatología anormal con temperaturas demasiado bajas que dan lugar a un desarrollo y maduración anormal del fruto, así como lluvias y desarrollo de oidio que puede provocar problemas en las plantas de defoliación incluso si se trata a tiempo. Se recomienda como medida preventiva un estricto control de la fertirrigación y del riego en las dosis recomendadas así como en caso de problemas de quemadura por sol la aplicación de recubrimientos para evitar el problema.

Según nuestro colega el profesor Antonio Alarcón (UPCT), "este año ha sido completamente anómalo para el cultivo del melón, los ciclos por el clima han tenido tendencia a retrasarse, pero los agricultores en general han pretendido sacar la fruta como si un año normal se tratase. con los consiguientes problemas de falta de aromas, brix, firmeza, cuajes defectuosos y plantaciones que se han caído antes de tiempo porque el agricultor ha pretendido forzar una maduración que aún no le correspondía a esa fruta, aunque por el número de días el agricultor pensaba que sí". Este diagnóstico coincide con el de la campaña 2008 que tenemos abajo en cuanto a la climatología y también en cuanto a la experiencia de que el tiempo después del cuaje solamente funciona bien en años con climatología "estándar" en cuanto al desarrollo del melón. Aunque a veces si es especialmente benigno se puede adelantar tanto floración como cuaje.

En las imágenes (Fotos 3-7) varios frutos del tipo "Ginsen Makuwa" de la campaña 2008 (C. melo sp. Agrestis, Group Makuwa cv. Ginsen Makuwa) tanto con la alteración como sin ella en nuestra campaña 2008, en la cual también se retrasó la maduración del fruto y las temperaturas fueron más bajas de lo normal y existió también lluvia en momentos inadecuados del cultivo.

Nuestro colega del USDA Gene Lester nos comenta que ha visto los síntomas en Honeydew del sur de Tejas, en la frontera con méjico, con un ambiente que podría ser similar al que tenemos en Murcia y alrededores. Sin embargo, lo chocante de esta sintomatología es que no aparece el pardeado típico del quemado por sol.

En el trabajo que publicamos en HortTechnology (ver entrada anterior del blog http://melonquality.blogspot.com.es/2013/06/revision-sobre-rajado-en-melon-melon.html)  y que se originó por una consulta sobre melón de corteza amarilla tipo ´Hami´, también aparecían estas decoloraciones de la corteza en melones que luego sufrían problemas de rajado en una campaña como la que tuvieron el pasado año allí bastante complicada también en cuanto a climatología y plagas (ver foto 8).

En todo caso no es descartable que el problema de decoloración esté asociado con algún problema por ahora desconocido, o una combinación de factores sobre los que no queremos especular aquí, por lo que si alguien tiene sugerencias se agradece que las aporte aquí. Recientemente se nos ha informado de que esos síntomas pueden ser causados por virus en sendas comunicaciones personales (Juan Antonio Martínez, UPCT; Miguel Aranda, CEBAS-CSIC). En la Región de Murcia hay un servicio de diagnóstico de estos virus en el IMIDA de La Alberca, y en Andalucía también prestan este servicio en Savia Biotech (Almería), según información facilitada por Miguel Aranda (investigador del CEBAS-CSIC, Murcia). Si aparecen otros síntomas especialmente es conveniente realizar el diagnóstico para saber si es debido a este problema.

Por último adjunto el comentario de F.J. Tovar sobre el final de la plantación de la foto 1: "Se tomó la decisión de destruirla, puesto que no tenía aprovechamiento comercial. No se pudo apreciar nada sobre las hojas y  las plantas estaban muy sanas e incluso con crecimiento demasiado vigoroso y exceso de follaje. Nuestra conclusión/apreciación es que la decoloración tuvo lugar debido a los fuertes rocíos de la mañana, que hacían que le agua permaneciera en los frutos hasta el mediodía, ya que estos estaban demasiado tapados por las hojas (a causa del exceso de follaje)."


Foto 3.  Melón Ginsen Makuwa inmaduro.






Fotos 4 y 5. Melón Ginsen Makuwa con decoloración de corteza (skin discoloration) y maduro


Foto 6. Melón Ginsen Makuwa con primeros síntomas de decoloración en la corteza en un estado bastante inmaduro como se observa por la falta de lignificación dle pedúnculo y coloración verde de la misma.



Foto 7. Melón Ginsen Makuwa de una planta que sufrió problemas anteiores de oidio donde se observa decoloración de la corteza aunque el fruto todavía no está maduro.


Foto 8. Melón ´Hami´ cultivado en Estados Unidos y con síntomas de problemas de coloración irregular en la corteza como los que mencionamos aqui´. (Foto cortesía de Milas Russell, Sandstone Marketing, Yuma,
Arizona, Estados Unidos).
Palabras clave: Skin discoloration, sunscald, irregular ripening, abnormal ripening, melon, Cucumis melo L., Ginsen Makuwa, physiological disorders, preharvest.

Noticia actualizada a 12 de Noviembre de 2013. Fotografías del autor (melón Ginsen makuwa) salvo aquellas con mención expresa.